Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700061G19RikQ08EE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms