Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms