Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3bp2Q06649 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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