Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms