Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINDOCQ05AH6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPINDOCQ05AH6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms