Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dnal1Q05A62 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dnal1Q05A62 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms