Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprgQ05909 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms