Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nf1Q04690 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms