Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr5Q04683 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cxcr5Q04683 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms