Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms