Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms