Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ddr1Q03146 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms