Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms