Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nhlh1Q02576 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlh1Q02576 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms