Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms