Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bmp1P98063 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms