Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlkP97793 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AlkP97793 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AlkP97793 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlkP97793 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms