Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irf3P70671 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms