Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sparcl1P70663 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms