Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tp53bp1P70399 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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