Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx3P70354 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms