Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smad1P70340 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms