Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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