Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps4xP62702 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms