Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp46P62069 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp46P62069 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp46P62069 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp46P62069 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms