Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3eP60229 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms