Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp1P59110 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp1P59110 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Senp1P59110 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms