Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms