Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pex2P55098 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms