Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtskP55097 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtskP55097 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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