Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms