Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClgnP52194 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClgnP52194 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms