Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gli1P47806 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gli1P47806 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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