Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf1P46099 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms