Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms