Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SsbP32067 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SsbP32067 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SsbP32067 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SsbP32067 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SsbP32067 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SsbP32067 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SsbP32067 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms