Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd28P31041 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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