Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VtnP29788 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VtnP29788 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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