Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

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Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tap1P21958 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tap1P21958 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms