Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcer1aP20489 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms