Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18532 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18532 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P18532 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P18532 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms