Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtpraP18052 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms