Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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