Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P10404 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P10404 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P10404 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms