Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefmP08553 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefmP08553 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefmP08553 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefmP08553 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NefmP08553 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms