Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prp2P05143 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms