Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01787 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01787 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01787 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01787 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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