Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gnpda1O88958 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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