Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BlmO88700 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BlmO88700 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms