Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms